Создаем папку для хранения временных файлов, например: /var/lib/mysql/tmp
mkdir /var/lib/mysql/tmp
Изменяем владельца папки и группу на mysql
chown mysql:mysql /var/lib/mysql/tmp
Выясняем идентификатор пользователя (uid) и группы (gid) mysql
id mysql
В файл fstab добавляем запись
tmpfs /var/lib/mysql/tmp tmpfs rw,gid=27,uid=27,size=4G,nr_inodes=10k,mode=0700 0 0
Монтируем новый tmpfs раздел
mount /var/lib/mysql/tmp
Редактируем файл конфигурации MySQL /etc/mysql/my.cnf
tmpdir=/var/lib/mysql/tmp
Перезапускаем MySQL
/etc/init.d/mysql restart